近期，华大营养联合华大研究院等机构在国际预印本平台bioRxiv上发布了一项研究。团队成功构建了双歧杆菌科与乳杆菌科完整基因组数据集，包含3,300株高质量完整基因组，其中1,151株为新分离自中国的本土菌株（部分由华大营养提供并参与研究）。

为什么完整基因组如此关键？

过去，大量益生菌菌株仅有16S鉴定或生化特征数据，即便是已测序的菌株也多停留在“草图基因组”层面，好比一幅残缺的拼图，大块的板块勉强拼上了，细碎的碎片却散落一地、无从得知全貌。本研究借助华大自主研发的DNBSEQ-T1与CycloneSEQ测序平台，采用短读长与长读长混合组装策略，为每一株菌绘制出完整的“高清地图”。

从“草图”升级为完整基因组后，大量与应激耐受、表面多糖合成、营养利用相关的关键功能基因被成功捕获。以副干酪乳杆菌为例，超过63%的菌株在应激与离子稳态功能注释上得到修正，超过50%的菌株表面粘附及代谢功能相关的通路信息得到补全。这意味着，我们终于能够看清这些益生菌真正的“看家本领”。

中国本土菌株自带“主场优势”

研究还揭示了一个引人深思的现象，大部分中国人肠道中的双歧杆菌科和乳杆菌科组成情况与西方人群截然不同，这两类益生菌的主要物种在中国人群肠道中的出现频率均超过60%，远高于美国和荷兰人群，表明这些益生菌家族是中国人肠道菌群中不可或缺的一部分。

进一步分析更令人惊喜，以长双歧杆菌、假链状双歧杆菌、短乳杆菌为代表的中国分离株，在与肠道关键微生物的互补和竞争互动中，与中国人的肠道微生态网络的默契程度更高，在促进肠道健康方面拥有天然的“优势”。

其中，多株植物乳植杆菌展现出卓越的基因组可塑性和肠道适应潜力，在本数据集中功能特征突出，在中国人群中尤其丰富。这与华大营养长期深耕BGI-N1、BGI-N6、BGI-J9等植物乳植杆菌的研发方向高度契合。

此外，副干酪乳杆菌和鼠李糖乳杆菌的中国分离株同样展现出显著的代谢互作优势——它们与弗格森埃希菌（Escherichia fergusonii）、副枝状丁酸单胞菌（Butyricimonas paravirosa）和产气克雷伯菌（Klebsiella aerogenes）等关键物种之间的代谢距离明显小于欧洲菌株。代谢距离越小，意味着菌株之间发生代谢物交换和功能互作的频率越高。

长双歧杆菌和假链状双歧杆菌，则是华大营养此次分离数量最多的两个物种，其中国分离株对多数肠道关键物种均表现出更小的代谢距离，预示着它们与本土肠道菌群之间的代谢“交流”更加顺畅，能够更高效地参与肠道微生态网络的运转。

正是这批解锁完整基因组、自带“优势”的中国本土菌株，构成了华大营养“优美达”系列产品以及“益人益方”个性化肠道健康管理方案的菌株基石。

从菌株到产品精准如何落地

早在2008年，华大便作为非欧盟组织参与MetaHIT计划，由此开启了肠道微生物领域的持续探索。如今，华大已建成储存量超7万株的健康国人共生菌株库，上万株核心菌株完成全基因组测序。

从草图到完整基因组，提升的不只是基因序列的连续性，更是对于益生菌功能认知的精度与深度。而从菌株到产品，“菌株筛选-功能验证-人群测试”循证全链条的构建，则是将这种精度与深度转化为消费者手中实实在在的健康价值。

过去，产品宣称的功能缺乏基因组层面的系统验证，消费者也难以判断哪一款益生菌能真正适配自己的需求。这项研究用3300幅完整基因组图谱给出了答案——每一株菌的应激耐受能力、营养利用潜力、肠道互作优势，都在其基因序列上有清晰的标识。

【责任编辑:冯孔】

来源：新华网